حدد مجلس التعليم العالي، آلية قبول الطلاب في الجامعات السورية الخاصة، بأن يتم القبول بعد إعلان مفاضلة يصدرها مجلس الجامعة، ويحدد فيها الشروط والتعليمات الناظمة، حيث تتناسب مع قرارات مجلس التعليم العالي والتعليمات الوزارية.
ويبلّغ نسخة من القرار، إلى مديرية المؤسسات التعليمية الخاصة، قبل إعلانه عبر الموقع الإلكتروني للجامعة، مع مراعاة أن يتم الإعلان، بعد صدور نتائج الدورة الثانية للثانوية العامة، وأن تحدد الجامعة في الإعلان الخاص بالمفاضلة، عدد المقاعد التي سيتم التفاضل عليها في كل اختصاص، وأن تقوم الجامعة بإجراء مفاضلة بين المتقدمين، وتعلن على موقعها الإلكتروني نتيجة المفاضلة لكل اختصاص.
وحسب القرار، يجوز للجامعة الإعلان عن مفاضلة ملء الشواغر في حال عدم استنفاد كل المقاعد المحددة، ويتم القبول وفق الحدود الدنيا المعلن عنها نتيجة القبول في المفاضة الأولى لكل اختصاص، وتُجرى المفاضلة في الجامعات الخاصة بإشراف معاون الوزير لشؤون المؤسسات التعليمية الخاصة.